儿科内在因素也会对睡眠产生影响：大脑神经发育尚未成熟。孩子的生理机能还没有形成规律的作息时间。婴儿昼夜生物钟的调整，取决于婴儿的生理成熟度。

调查显示，神经系统兴奋性较高的宝宝，生理成熟往往较晚，容易出现睡眠障碍。这类宝宝与睡眠好的宝宝相比，性格可能更趋于活泼、外向、敏感。

人的睡眠分为深度睡眠和浅度睡眠，夜间交替进行约 3-4 小时。同样，婴幼儿在深睡眠和浅睡眠之间交替的时间会稍短一些，约为 2-3 小时。成人和许多睡整夜觉的婴儿在浅睡眠到来时，能更好地调整自己回到深睡眠状态。也有很多小婴儿，甚至很多成年人无法自我调整睡眠，因此会从浅睡眠中醒来。

很多母乳喂养的婴儿无法自我调节，他们的心理渴望得到爱抚，而母亲的乳房无疑是对他们最大的安慰。当然，有时拥抱和边走边摇也能起到一定的效果。特别是随着神经系统的发育和大脑皮层的活跃，宝宝越大越容易出现不能自我调节的情况。这就是为什么四五个月后的宝宝比小时候睡得更差，醒得更频繁的原因。

排除口渴、饥饿、冷热、缺钙、腹胀、出牙兴奋等外界因素后，睡不好的宝宝可能只是大脑皮层活跃，无法自我调整进入深度睡眠。断奶后，或者随着宝宝的成长，这些现象总会解决的。